نتانیاهو از سال 2020 در حال محاکمه است و اولین نخست‌وزیر در حال خدمت اسرائیل محسوب می‌شود که به اتهامات جنایی محاکمه می‌شود. دادگاه شامل سه پرونده اصلی است که در نوامبر 2019 توسط دادستان کل وقت مطرح شد:

پرونده 1000: اتهام کلاهبرداری و نقض اعتماد عمومی. نتانیاهو و همسرش متهم هستند که هدایای گران‌قیمتی (به ارزش صدها هزار دلار) از دو میلیاردر - آرنون میلچان (تهیه‌کننده هالیوودی) و جیمز پکر (میلیاردر استرالیایی) - دریافت کرده‌اند و در قبال آن، خدمات و تسهیلات سیاسی و قانونی به آن‌ها ارائه کرده‌اند.

پرونده 2000: اتهام کلاهبرداری و نقض اعتماد عمومی. نتانیاهو متهم است که با آرنون موزس (ناشر روزنامه یدیعوت آحارونوت) توافقی غیرقانونی داشته: در ازای پوشش مثبت رسانه‌ای از خودش، نتانیاهو تلاش کند تا گردش روزنامه رقیب (اسرائیل هیوم) را محدود کند.

پرونده 4000: جدی‌ترین پرونده - اتهام رشوه، کلاهبرداری و نقض اعتماد عمومی. نتانیاهو در دوران تصدی وزارت ارتباطات متهم است که تصمیمات قانونی و مقرراتی به نفع شائول الوویچ (مالک سایت خبری والا) گرفته و در مقابل، پوشش خبری مثبت و مطلوب از خودش و خانواده‌اش در این رسانه دریافت کرده است.

نتانیاهو همه این اتهامات را رد کرده و آن‌ها را «توطئه سیاسی» و «شکار جادوگران» توصیف می‌کند. محاکمه از سال 2020 آغاز شده و بارها به دلایل مختلف (از جمله جنگ‌های غزه، لبنان و اخیراً جنگ با ایران) به تعویق افتاده است. در صورت محکومیت، ممکن است با مجازات زندان مواجه شود.